Cơ cấu dân số là gì? Các công bố khoa học về Cơ cấu dân số

Chúng tôi mô tả các cải tiến đối với phương pháp của Pritchard và cộng sự để suy diễn cấu trúc dân số từ dữ liệu genotype đa locus. Quan trọng nhất, chúng tôi phát triển các phương pháp cho phép có sự liên kết giữa các loci. Mô hình mới này xem xét các mối tương quan giữa các loci liên kết phát sinh trong các quần thể trộn lẫn (“mất cân bằng liên kết trộn lẫn”). Sự điều chỉnh này có một số lợi thế, cho phép (1) phát hiện các sự kiện trộn lẫn xa hơn vào quá khứ, (2) suy diễn quần thể nguồn gốc của các vùng nhiễm sắc thể, và (3) ước lượng chính xác hơn về sự không chắc chắn thống kê khi sử dụng các loci liên kết. Nó cũng có thể hữu ích cho việc lập bản đồ trộn lẫn. Thêm vào đó, chúng tôi mô tả một mô hình prior mới cho tần số allele trong mỗi quần thể, cho phép xác định các phân chia quần thể tinh tế mà không thể phát hiện được khi sử dụng phương pháp hiện có. Chúng tôi trình bày các kết quả áp dụng các phương pháp mới để nghiên cứu trộn lẫn ở người Mỹ gốc Phi, tái tổ hợp trong Helicobacter pylori, và trôi dạt trong các quần thể Drosophila melanogaster. Các phương pháp này được triển khai trong một chương trình, structure, phiên bản 2.0, có sẵn tại http://pritch.bsd.uchicago.edu.

Chất lượng đất là một thước đo tổng hợp về khả năng của đất trong việc hoạt động và mức độ hiệu quả của nó, so với một mục đích sử dụng cụ thể. Chất lượng đất có thể được đánh giá thông qua một bộ dữ liệu tối thiểu bao gồm các thuộc tính của đất như kết cấu, chất hữu cơ, độ pH, mật độ khối và độ sâu rễ. Chất hữu cơ trong đất có ý nghĩa đặc biệt đối với chất lượng đất vì nó có thể ảnh hưởng đến nhiều thuộc tính khác nhau của đất bao gồm cả các thuộc tính khác của bộ dữ liệu tối thiểu. Đánh giá chất hữu cơ trong đất là một bước quan trọng để xác định chất lượng tổng thể của đất và có thể cung cấp thông tin giá trị đến mức có thể được đưa vào các bộ dữ liệu tối thiểu được sử dụng để đánh giá đất trên toàn cầu. Trong bài tổng quan này, chất hữu cơ trong đất được coi là bao gồm một tập hợp các thuộc tính thay vì là một thực thể đơn lẻ. Các thuộc tính bao gồm và sẽ được thảo luận ở đây là carbon và nitơ hữu cơ tổng số trong đất, phần nhẹ và chất hữu cơ vi mô (hạt), carbon và nitơ có thể khoáng hóa, sinh khối vi sinh vật, carbohydrates và enzyme trong đất. Những thuộc tính này liên quan đến nhiều quá trình của đất, chẳng hạn như những quá trình liên quan đến việc lưu trữ dinh dưỡng, hoạt động sinh học và cấu trúc đất, và có thể được sử dụng để thiết lập các bộ dữ liệu tối thiểu khác nhau để đánh giá chất lượng chất hữu cơ trong đất. Từ khóa: Hoạt động sinh học, bộ dữ liệu tối thiểu, lưu trữ dinh dưỡng, chất hữu cơ trong đất, chất lượng đất, cấu trúc đất

Tóm tắt Để hiểu về sự bất bình đẳng trong sức khỏe giữa các dân tộc, chúng ta phải xem xét mối quan hệ giữa tình trạng thiểu số dân tộc, bất lợi cấu trúc và quyền tự quyết. Đến nay, các tác động trực tiếp của áp bức chủng tộc đối với sức khỏe, cũng như vai trò của bản sắc dân tộc - một phần là sản phẩm của quyền tự quyết - đã bị bỏ qua. Chúng tôi đặt mục tiêu khắc phục sự thiếu sót này bằng cách sử dụng dữ liệu từ Khảo sát Quốc gia lần thứ Tư về các Dân tộc Thiểu số. Phân tích nhân tố cho thấy các chiều kích của bản sắc dân tộc là nhất quán giữa các nhóm dân tộc thiểu số khác nhau. Ban đầu, một số chiều kích của bản sắc dân tộc dường như có liên quan đến sức khỏe, nhưng trong mô hình đa biến, yếu tố liên quan đến bản sắc chủng tộc là yếu tố duy nhất thể hiện mối quan hệ với sức khỏe. Những phát hiện này cho thấy bản sắc dân tộc không liên quan đến sức khỏe. Thay vào đó, các phân tích đa biến được trình bày ở đây cho thấy mối quan hệ độc lập mạnh mẽ giữa sức khỏe và những trải nghiệm liên quan đến phân biệt chủng tộc, phân biệt chủng tộc cảm nhận được và tầng lớp xã hội.

Phân bón hữu cơ được biết đến là có khả năng làm tăng phát thải khí N₂O trong đất thông qua việc kích thích quá trình nitrat hóa và khử nitrat. Mục tiêu của nghiên cứu này là so sánh những phát thải khí N₂O trên bề mặt đất sau khi bón phân từ phân bò tươi dạng lỏng và dạng rắn trên đất thịt và đất sét trồng ngô silage. Phân đã được bón trong 2 năm liên tiếp với mức tương đương 150 kg N tổng/ha và được so sánh với một biện pháp đối chứng tương ứng nhận mức văn hóa N tổng hợp. Sự xung phong khí N₂O trên bề mặt đất, nhiệt độ đất, và hàm lượng nước, nitrat và amoni trong đất đã được giám sát hàng tuần tại các ô phân bón và ô đối chứng. Từ 60 đến 90% tổng phát thải khí N₂O theo mùa xảy ra trong 40 ngày đầu sau khi bón phân và phân bón tổng hợp, cho thấy rằng ngoài khoảng thời gian này, một hoặc nhiều yếu tố đã hạn chế phát thải N₂O. Thời gian phát thải cao hơn sau khi bón phân và phân bón tổng hợp tương ứng với giai đoạn mà hàm lượng N khoáng trong đất lên cao nhất (lên tới 17 g NO₃⁻-N m^-2) và không gian lấp đầy bằng nước trong lỗ rỗng (WFPS) vượt quá 0.5 m³ m^-3. Sự thiếu hụt dòng khí N₂O đáng kể sau này trong mùa sinh trưởng mặc dù mức WFPS cao cho thấy rằng tác động kích thích của các phụ phẩm N hữu cơ và tổng hợp lên sản xuất N₂O trong đất là có thời gian tương đối ngắn. Việc bón phân silage ngô bằng phân bò tươi đã dẫn tới phát thải N₂O cao hơn hoặc tương đương so với việc sử dụng N tổng hợp. Điều này đã được quan sát mặc dù hàm lượng N khoáng tổng thể trong đất có sử dụng phân bón thấp hơn, cho thấy rằng các yếu tố khác bị ảnh hưởng bởi phân, có thể là thêm các cơ chất C và sự hô hấp đất được cải thiện, đã dẫn đến khử nitrat nhiều hơn và sản xuất N₂O cao hơn. Năng suất ngô silage trong đất bón phân thấp hơn so với đất nhận phân N tổng hợp, cho thấy rằng phát thải N₂O trên mỗi kilogram sinh khối thu hoạch cao hơn đối với phân so với phân N tổng hợp. Kết quả của chúng tôi cũng cho thấy rằng nguồn chính phát thải N₂O là nitrat hóa trong đất thịt và khử nitrat trong đất sét. Không có sự khác biệt rõ ràng về phát thải N₂O giữa phân bón dạng lỏng và dạng rắn. Những tác động khác nhau của việc bổ sung phân bón dạng lỏng và dạng rắn được báo cáo trong tài liệu về phát thải N₂O trong đất có thể do thành phần khác nhau của chính các loại phân cũng như do sự tương tác với các yếu tố khác như môi trường đất và các phương pháp canh tác. Cần có sự đặc trưng tốt hơn về khả năng sẵn có của C và N trong phân để đánh giá tác động của việc bón phân lên phát thải N₂O trong điều kiện thực địa. Từ khóa: Khí nhà kính, N₂O, ngô, phân bón

Việc tìm kiếm các biến thể gen hiếm có liên quan đến các bệnh phức tạp có thể được hỗ trợ bằng cách làm giàu cho những người mang biến thể hiếm bằng cách lấy mẫu các trường hợp từ gia phả có bệnh, có thể có nhóm đối chứng liên quan hoặc không liên quan. Tuy nhiên, chiến lược này làm phức tạp các phân tích do nguồn gốc di truyền chia sẻ cũng như sự liên kết không cân bằng giữa các dấu hiệu di truyền. Để khắc phục những vấn đề này, chúng tôi đã phát triển các loại chỉ số "gánh nặng" và chỉ số kernel rộng rãi, mở rộng các phương pháp thường được sử dụng cho dữ liệu trường hợp - đối chứng không có liên quan để cho phép các mối quan hệ gia phả đã biết, cho các nhiễm sắc thể thường và nhiễm sắc thể X. Hơn nữa, bằng cách thay thế ma trận tương quan di truyền dựa trên gia phả bằng những ước lượng về các mối quan hệ di truyền dựa trên dữ liệu gen quy mô lớn, các phương pháp của chúng tôi có thể được sử dụng để tính đến dữ liệu có cấu trúc dân số. Qua các mô phỏng, chúng tôi cho thấy rằng tỷ lệ sai số loại I của các phương pháp đã phát triển gần đạt đến mức danh nghĩa tiệm cận, cho phép tính toán nhanh chóng các giá trị P. Các mô phỏng của chúng tôi cũng cho thấy rằng một thống kê kernel có trọng số tuyến tính thường mạnh hơn một thống kê "gánh nặng" có trọng số. Vì các thống kê đề xuất có tính toán nhanh, chúng có thể được sử dụng dễ dàng cho việc sàng lọc quy mô lớn về mối liên quan giữa dữ liệu chuỗi gen với trạng thái bệnh.